Rôle de la dynamique conformationnelle dans la fonction protéique

Conformational dynamics in protein function

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L’axe « rôle de la dynamique conformationnelle dans la fonction protéique » est un des axes transverses de recherche majeurs du laboratoire « Bioénergétique et Ingénierie des Protéines ». Ce nouvel axe regroupe des membres de plusieurs équipes du BIP (BIP 01, BIP 02, BIP 06, BIP 07, BIP 08 et BIP 09).

Nous cherchons à élucider le rôle de la dynamique conformationnelle à l’échelle moléculaire sous différentes formes:

  1. étude du contrôle ou de la régulation de l’activité protéique (rédox, mécanisme enzymatique, interactions protéine-protéine) par la dynamique conformationnelle,
  2. étude des interactions de protéines chaperons avec leurs partenaires,
  3. étude du fonctionnement de transporteurs membranaires et de l’interaction avec leurs partenaires.

Pour cela, nous mettons en place des approches et techniques d’étude multiples associant la biochimie, l’électrochimie, l’enzymologie, la modélisation (dynamique moléculaire), les spectroscopies magnétiques (RMN, RPE) et optiques (UV-Visible, dichroïsme circulaire, fluorescence), des techniques de SAXS/SANS, de microscopie et des méthodes in situ, operando et in cell.

The theme « conformational dynamics in protein function » is one of the major cross-cutting research axes of the « Bioenergetics and Protein Engineering » (BIP) laboratory. This new axis brings together members from several teams of the BIP (BIP 01, BIP 02, BIP 06, BIP 07, BIP 08 and BIP 09).

We seek to elucidate the role of conformational dynamics at the molecular scale in different forms:

  1.  study of the control or regulation of protein activity (redox, enzymatic mechanism, protein-protein interactions) by conformational dynamics,
  2. study of chaperone protein interactions with their partners,
  3. study of the functioning of membrane transporters and their interaction with partners.

To achieve this, we implement multiple approaches and techniques, combining biochemistry, electrochemistry, enzymology, modelisation (molecular dynamics), magnetic (NMR, EPR) and optical (UV-Visible, circular dichroism, fluorescence) spectroscopies, microscopy, SAXS/SANS techniques, as well as in situ, operando, and in cell methods.